Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MAP1LC3CQ9BXW4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms