Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TMEM79Q9BSE2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TMEM79Q9BSE2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms