Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TSNARE1Q96NA8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms