Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL15Q96M94 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KLHL15Q96M94 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms