Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CAPNS2Q96L46 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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