Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
LINC00208Q96KT6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LINC00208Q96KT6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms