Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC34Q96HJ3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC34Q96HJ3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms