Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RNF185Q96GF1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms