Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EXOSC8Q96B26 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms