Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMPDL3AQ92484 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms