Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ZNF439Q8NDP4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ZNF439Q8NDP4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms