Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CCDC197Q8NCU1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms