Protein–RNA interactions for Protein: Q86WS5

TMPRSS12, Transmembrane protease serine 12, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS12Q86WS5 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TMPRSS12Q86WS5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms