Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC29A4Q7RTT9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SLC29A4Q7RTT9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms