Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LRRC9Q6ZRR7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC9Q6ZRR7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms