Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NFXL1Q6ZNB6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms