Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CASC2Q6XLA1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CASC2Q6XLA1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms