Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZBED9Q6R2W3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZBED9Q6R2W3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms