Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZCCHC12Q6PEW1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms