Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRNQ16849 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRNQ16849 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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