Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RTN1Q16799 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms