Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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CDKN3Q16667 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CDKN3Q16667 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CDKN3Q16667 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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