Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HMGN3Q15651 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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