Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERPUD1Q15011 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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