Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CACNA1SQ13698 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACNA1SQ13698 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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