Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.224e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.234e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.284e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.444e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.351e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 218.73■□□□□ 0.593e-34■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS16-208ENST00000602153 444 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-34■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPP7-208ENST00000478597 943 ntTSL 330.38■■■□□ 2.451e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPP7-211ENST00000485456 968 ntTSL 529.03■■■□□ 2.241e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPP7-213ENST00000497375 817 ntTSL 520.64■□□□□ 0.891e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-11■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BAX-207ENST00000502487 1346 ntTSL 1 (best)31.74■■■□□ 2.672e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BAX-209ENST00000506183 383 ntTSL 1 (best)20.63■□□□□ 0.892e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.812e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BAX-204ENST00000356483 677 ntTSL 1 (best)19.84■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 218.04■□□□□ 0.484e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 217.72■□□□□ 0.434e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-211ENST00000529645 606 ntTSL 315.53■□□□□ 0.084e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.467e-50■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.287e-50■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-50■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -07e-50■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.987e-50■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 PLD3-213ENST00000488311 750 ntTSL 214.82□□□□□ -0.047e-32■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 AC012254.2-201ENST00000602459 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.15■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 IER3IP1-201ENST00000256433 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 AC012254.2-202ENST00000602926 291 ntAPPRIS ALT2 TSL 27.15□□□□□ -1.262e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 528.43■■■□□ 2.147e-8■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MAGEB1-201ENST00000378981 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MAGEB1-202ENST00000397548 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.116e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MAGEB1-203ENST00000397550 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.356e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.112e-15■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.711e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-212ENST00000492213 550 ntTSL 425.35■■□□□ 1.651e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-206ENST00000443002 1890 ntTSL 224.4■■□□□ 1.51e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.291e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-209ENST00000483713 615 ntTSL 318.42■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 POLR2F-210ENST00000484894 551 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 16.2
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PABPC4Q13310 RPL18-207ENST00000549533 666 ntTSL 221■□□□□ 0.955e-54■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.415e-13■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TSTA3-214ENST00000531473 2220 ntTSL 1 (best)22.2■■□□□ 1.145e-13■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TSTA3-210ENST00000529064 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.15e-13■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.258e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.038e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.58e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.078e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -08e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-214ENST00000551123 1417 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.18e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.388e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)11.47□□□□□ -0.578e-28■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.116e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.686e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.646e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 HEBP2-203ENST00000453452 512 ntTSL 38.72□□□□□ -1.016e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NTPCR-207ENST00000494689 767 ntTSL 215.34■□□□□ 0.051e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NTPCR-208ENST00000496662 882 ntTSL 213.81□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NTPCR-206ENST00000490807 980 ntTSL 212.29□□□□□ -0.441e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NTPCR-202ENST00000366628 6311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NTPCR-205ENST00000490098 8705 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.161e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 325.81■■□□□ 1.729e-8■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 ZNF580-205ENST00000592461 377 ntTSL 324.47■■□□□ 1.519e-8■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-208ENST00000531989 1573 ntTSL 319.8■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.661e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-202ENST00000415073 2085 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.041e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-201ENST00000252268 2462 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.581e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-209ENST00000532052 3165 ntTSL 210.11□□□□□ -0.791e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 DPF2-204ENST00000524666 4840 ntTSL 29.41□□□□□ -0.91e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 COX6B1-201ENST00000246554 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.071e-17■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.136e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.39e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.129e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NT5DC2-215ENST00000492555 2004 ntTSL 1 (best)19.8■□□□□ 0.769e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NT5DC2-201ENST00000307076 2047 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.219e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 KIF2C-202ENST00000372224 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.53e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 KIF2C-201ENST00000372217 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.783e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.351e-25■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TOMM7-204ENST00000463284 731 ntTSL 215.81■□□□□ 0.121e-25■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 UBR4-203ENST00000375225 1533 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.267e-9■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC9.07□□□□□ -0.961e-25■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPL29-206ENST00000481629 880 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.65e-38■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 RPL29-207ENST00000486565 574 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.055e-38■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 CAT-205ENST00000534710 1020 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.283e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.363e-12■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.358e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.693e-6■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 519.37■□□□□ 0.696e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-209ENST00000483553 1307 ntTSL 519.17■□□□□ 0.666e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-213ENST00000491994 866 ntTSL 218.55■□□□□ 0.566e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)16.36■□□□□ 0.216e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.22□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.486e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 HSPB1-202ENST00000429938 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.292e-33■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.285e-7■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 NPM3-202ENST00000462391 481 ntTSL 325.68■■□□□ 1.76e-8■■■□□ 16.2
PABPC4Q13310 LRRC59-202ENST00000503118 438 ntTSL 58.41□□□□□ -1.063e-9■■■□□ 16.1
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