Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SRSF5Q13243 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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