Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FOXD4Q12950 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXD4Q12950 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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