Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRAF2Q12933 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRAF2Q12933 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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