Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD47Q08722 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD47Q08722 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD47Q08722 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms