Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD300CQ08708 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD300CQ08708 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms