Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
EGR3Q06889 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
EGR3Q06889 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms