Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPB1Q06547 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms