Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SRSF11Q05519 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms