Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CACNA1DQ01668 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms