Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HSF1Q00613 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HSF1Q00613 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms