Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RPS28P62857 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS28P62857 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS28P62857 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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