Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB1AP62820 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms