Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FXYD4P59646 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms