Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ARFIP1P53367 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ARFIP1P53367 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms