Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RORCP51449 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RORCP51449 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RORCP51449 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RORCP51449 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms