Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CCT3P49368 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCT3P49368 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCT3P49368 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms