Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK8P49336 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK8P49336 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK8P49336 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK8P49336 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK8P49336 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms