Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATP2B1P20020 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATP2B1P20020 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms