Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms