Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRAPPC2P0DI81 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms