Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IGKV3-15P01624 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms