Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ATG7O95352 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms