Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GABARAPO95166 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms