Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TSPAN2O60636 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms